Die Anfänge der neuapostolischen Kirchengemeinde Wittershausen gehen in das Jahr 1934 zurück.
Männer und Frauen aus Vöhringen und Bergfelden luden in die neuapostolische Kirche ein. In dieser Zeit wurden viele Aufklärungsgottesdienste gehalten, die nicht ohne Erfolg geblieben sind. Werner Schäfenacker war der erste neuapostolische Christ aus Wittershausen. Er empfing 1934 das Sakrament der Heilgen Versiegelung.
Nach den Kriegswirren kamen 1948 weitere Mitglieder hinzu. Ab diesem Zeitpunkt wurden die Wochengottesdienste in Wittershausen abgehalten. Die Gottesdienste am Sonntag wurden in Vöhringen besucht.
Am 01.01.1950 wurde die heranwachsende Gemeinde selbständig. Von 1950 - 1960 fanden die Gottesdienste im Wohnhaus der Familie Schäfenacker statt. Durch das ständige Wachsen der Gemeinde war es notwendig, sich nach einem größeren Lokal bzw. einem Bauplatz umzusehen.
Von der Familie Gühring konnte ein geeignetes Grundstück zum Bau einer Kirche erworben werden. Mitte des Jahres 1959 wurde mit dem Bau der Kirche im Langenäckerweg 8 begonnen, welche am 2. April 1960 durch Bischof Sikeler ihrer Bestimmung übergeben wurde.
1970 wurde die Kirche renoviert, doch schon 10 Jahre später entsprachen die Räumlichkeiten des Kirchleins nicht mehr den Bedürfnissen der stetig wachsenden Gemeinde. Die Kirchenverwaltung entschloss sich zum Bau einer neuen Kirche.
Im August 1980 wurde mit dem Abbruch der alten Kirche begonnen, um am selben Platz eine neue zu errichten. Das neue Gotteshaus wurde am 20.06.1982 durch Bezirksapostel Kühnle eingeweiht.
Wegen eines Wasserschadens musste die Kirche ab November 2000 bis April 2001 renoviert werden. In der Zeit des Umbaus besuchten die Gemeindemitglieder die Gottesdienste in Sigmarswangen. Am 16. Juni 2001 wurde zum Wiederbezug eine Feierstunde durchgeführt. Chor und Orchester sowie die Grußworte des Ortsvorstehers Ernst Breil erfreuten die Zuhörer.
Vorsteher der Gemeinde waren von 1950 - 1980 Priester Werner Schäfenacker, von 1980 - 1997 Priester Wilhelm Kipp und von 1997 - 2013 Priester Albert Schäfenacker. Von 2013 – 2025 leitete Priester Jochen Schäfenacker die Gemeinde.
Nach der Schließung der benachbarten Kirchengemeinde Sigmarswangen am 25. Mai 2025 wegen eines vorausgegangenen Brandschadens entschlossen sich einige der dortigen Geschwister, künftig die Gottesdienste in der Gemeinde Wittershausen zu besuchen. Seither wirkt Bezirksevangelist Dieter Winzenried als Vorsteher der Gemeinde.